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    建立自然保護區(qū)開展就地保護是保護生物多樣性最根本、最有效的措施和手段。

    2003年以來，云南省自然保護區(qū)建設和濕地管理工作有新突破，一是編制完成全省兩大規(guī)劃。在全國率先編制完成《云南省生物多樣性保護工程規(guī)劃》，在全省首次完成《云南省濕地保護工程規(guī)劃》，2項規(guī)劃均于2007年底得到省政府批準。二是保護區(qū)由數(shù)量型向質(zhì)量型轉變。三年來5個省級保護區(qū)晉升為國家級自然保護區(qū)，新增省級自然保護區(qū)2處。截至2007年12月，云南省16個國家級自然保護區(qū)林業(yè)部門管理的有13處，面積131.67萬公頃。省級自然保護區(qū)37處，面積74.7萬公頃。國家級和省級保護區(qū)面積占全省國土面積的5%。這些保護區(qū)中有2處“人與生物圈保護區(qū)”，4處“國際重要濕地”，5處在“三江并流”世界遺產(chǎn)地范圍內(nèi)。實施了國家級自然保護區(qū)基礎設施建設項目20個，爭取國家投資1.17億元。自然保護區(qū)實現(xiàn)了從搶救性保護階段向規(guī)范管理過渡，西雙版納、高黎貢山和白馬雪山3個國家級保護區(qū)已列為國家林業(yè)局示范保護區(qū)建設試點范圍。三是積極推進自然保護區(qū)規(guī)范科學管理。云南省進一步加強科學考察和總體規(guī)劃工作，為保護區(qū)提供規(guī)范管理依據(jù)，共組織完成5個國家級保護區(qū)科學考察，3個國家級保護區(qū)補充調(diào)查，編制和修編11個國家級保護區(qū)總體規(guī)劃。完成12個省級保護區(qū)綜合科學考察，14個省級保護區(qū)總體規(guī)劃，建立起保護區(qū)監(jiān)測體系。加強了管理人員培訓，共舉辦培訓班41期，培訓1100多人次。四是創(chuàng)新決策機制，妥善處理工程建設與保護的矛盾。建立“生物多樣性影響評價”和“專家咨詢評審”制度，積極協(xié)調(diào)不同利益主體之間的關系。在全國首次推出《自然保護區(qū)生物多樣性影響評價技術規(guī)范》得到國家林業(yè)局肯定，在全國參照執(zhí)行。妥善處理了公路、鐵路，以及國家重大水電、交通建設工程涉及自然保護區(qū)的矛盾，最大限度減少生物多樣性損失，保護了生態(tài)景觀。五是開拓創(chuàng)新，探索生物多樣保護新模式。積極參與和組織滇西北生物多樣性保護會議，在《云南省人民政府在關于加強滇西北生物多樣性保護的若干意見》中，確立林業(yè)部門在滇西北生物多樣性保護工作中的實施主體地位。開展國家公園建設試點工作。國家林業(yè)局已批準將云南省列為國家公園建設試點省。六是濕地保護管理有了新突破。2004年，組織申報大山包、碧塔海、納帕海、拉市海為國際重要濕地，使云南成為我國國際重要濕地最多的省份。2006年，林業(yè)部門管理的6個高原濕地保護區(qū)保護建設項目獲得國家批準，已投資2354萬元。2007年，紅河哈尼梯田被國家林業(yè)局批準為國家濕地公園。