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    2008年7月7日－10日，國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)管理評(píng)估組受國(guó)家環(huán)境保護(hù)部的委派，先后來(lái)到九段沙濕地國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)和崇明東灘鳥(niǎo)類國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)，就保護(hù)區(qū)的管理工作進(jìn)行評(píng)估。

　　本次評(píng)估工作是按照環(huán)境保護(hù)部、國(guó)土資源部、水利部、農(nóng)業(yè)部、國(guó)家林業(yè)局、中國(guó)科學(xué)院、國(guó)家海洋局聯(lián)合下發(fā)的《關(guān)于開(kāi)展國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)管理評(píng)估工作的通知》（環(huán)辦[2008]19號(hào)）的要求，采取實(shí)地考察、資料和文件查閱、聽(tīng)取自評(píng)估報(bào)告、與相關(guān)利益者座談、討論評(píng)議、評(píng)估打分、最終評(píng)定管理水平等級(jí)的評(píng)估方式進(jìn)行的。

　　7月7日，評(píng)估組聽(tīng)取了九段沙保護(hù)區(qū)管理署的工作匯報(bào)，實(shí)地檢查了九段沙濕地的現(xiàn)狀，并檢查了保護(hù)區(qū)成立以來(lái)的相關(guān)資料、文檔和文件；7月8日評(píng)估組與保護(hù)區(qū)周邊社區(qū)及本保護(hù)區(qū)工作人員進(jìn)行了座談；經(jīng)過(guò)評(píng)估，九段沙濕地國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)的評(píng)估得分為87分，管理水平等級(jí)為“優(yōu)”。7月9日，評(píng)估組實(shí)地檢查了崇明東灘鳥(niǎo)類國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)管理處辦公樓、捕魚(yú)港管護(hù)站、白港管護(hù)站、團(tuán)結(jié)沙管護(hù)站、北八滧管護(hù)站及北八滧環(huán)境教育中心等基礎(chǔ)設(shè)施，聽(tīng)取了保護(hù)區(qū)管理處的匯報(bào)，查閱了保護(hù)區(qū)管理處的檔案；7月10日，評(píng)估組與崇明水務(wù)局堤防站、上實(shí)公司、陳家鎮(zhèn)政府、崇明東灘濕地保護(hù)區(qū)派出所、邊防武警崇明東灘派出所及保護(hù)區(qū)管理處職工代表進(jìn)行了座談，經(jīng)過(guò)評(píng)估，崇明東灘鳥(niǎo)類國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)的評(píng)估得分為89分，管理水平等級(jí)為“優(yōu)”。

　　評(píng)估組認(rèn)為，九段沙濕地國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)和崇明東灘鳥(niǎo)類國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)的管理工作已得到了各級(jí)政府和有關(guān)部門(mén)的高度重視，上海市人民政府先后頒布和實(shí)施了《上海市崇明東灘鳥(niǎo)類自然保護(hù)區(qū)管理辦法》和《上海市九段沙濕地自然保護(hù)區(qū)管理辦法》，將保護(hù)區(qū)保護(hù)管理工作納入了依法管理的軌道；保護(hù)區(qū)管理機(jī)構(gòu)基本健全，人員配置比較合理，運(yùn)行經(jīng)費(fèi)保障程度高；保護(hù)區(qū)管理工作規(guī)范，保護(hù)成效顯著，已經(jīng)成為了具有自身特點(diǎn)的示范保護(hù)區(qū)。

　　同時(shí)，評(píng)估組也指出，上海市國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)管理仍然存在以下問(wèn)題：

　　1、外來(lái)物種――互花米草對(duì)崇明東灘和九段沙濕地生態(tài)系統(tǒng)的健康及生物多樣性已造成威脅。

　　2、《上海市崇明東灘鳥(niǎo)類自然保護(hù)區(qū)管理辦法》和《上海市九段沙濕地自然保護(hù)區(qū)管理辦法》的部分規(guī)定已不適于保護(hù)區(qū)的現(xiàn)狀，給保護(hù)區(qū)的依法管理帶來(lái)了困難。

　　3、九段沙自然保護(hù)區(qū)管理署的機(jī)構(gòu)設(shè)置不夠完善，給保護(hù)區(qū)有效開(kāi)展對(duì)外協(xié)調(diào)和交流帶來(lái)了很大的難度。

　　4、保護(hù)與開(kāi)發(fā)的矛盾依然存在。如人類活動(dòng)對(duì)崇明東灘自然保護(hù)區(qū)周邊環(huán)境的壓力日益增大，對(duì)保護(hù)區(qū)的主要保護(hù)對(duì)象存在一定的影響。

　　5、保護(hù)區(qū)的基礎(chǔ)設(shè)施和能力建設(shè)方面尚有一定差距。比如崇明東灘保護(hù)區(qū)管理處的辦公用房目前還是租用其他單位的，這不利于保護(hù)區(qū)總體規(guī)劃實(shí)施及功能性設(shè)施建設(shè)。